本页提供以下三种工具用于分析时间序列中的平均荧光强度变化：

CalmAnalyzer (Matlab)

Calcium Imaging Analyzer (Fiji)

Voltage Imaging Analyzer (Fiji)

CalmAnalyzer

方法介绍

该方法主要用于分析时间序列中 ROI 区域的平均荧光强度变化。根据所圈 ROI，可快速输出各个 ROI 区域的平均荧光强度变化曲线、平均荧光强度中位数变化曲线以及变化率热图。该方法基于 Matlab 语言，包含 GUI 界面，易于操作。

GUI 操作界面

根据提示，载入数据 → 添加 ROI → 设置 BaseTime & 帧率。

结果输出

图1. ROI 的平均荧光强度变化曲线；图2. 所圈 ROI 的平均荧光强度变化平均值曲线；图3. ROI 变化率热度图。

根据所选 ROI，一键输出各个 ROI 平均荧光强度变化曲线、所有 ROI 变化平均数曲线以及各个 ROI 变化率热度图。

Calcium Imaging Analyzer

方法介绍

该方法主要用于分析时间序列中 ROI 区域的平均荧光强度变化。根据所圈 ROI，可快速输出各个 ROI 区域的平均荧光强度变化曲线。该方法基于 Fiji 语言，便于安装操作。

Fiji 操作界面

设置 Basal → 选择 ROI；根据提示，载入数据 → 设置 BaseTime & 帧率 → 添加 ROI。

结果输出

图2. ROI 平均荧光强度变化曲线；图2. 所圈 ROI 平均荧光强度值；图3. 自动生成 CSV 文件。

根据所选 ROI，输出各个 ROI 平均荧光强度变化曲线、所圈 ROI 平均荧光强度值以及对应的 CSV 文件，便于后期数据分析。

注：该插件基于帝国理工影像中心 Fiji 宏工具包修改实现。

Voltage Imaging Analyzer

方法介绍

该方法主要用来对 Voltron 标记的神经元电压信号进行预处理和展示，先对信号进行 bleach 校正，再计算出相应的 SNR。该方法基于 Fiji，便于安装及使用，可以快速对信号进行分析和展示。

Fiji 操作界面

根据提示，添加多个 ROI，点击 OK 进行计算。

结果输出

图3. 所圈 ROI 中平均 SNR 的变化曲线；图2. 所圈 ROI 的平均 SNR 值输出；图3. 自动生成 CSV 文件。

根据所选 ROI，生成多个 ROI 区域的 SNR 变化曲线、所圈 ROI 的平均 SNR 值以及对应的 CSV 文件，便于后期数据分析。

注：该插件基于帝国理工影像中心 Fiji 宏工具包修改实现。