光学影像中心作为北京脑科学与类脑研究所下设的重要辅助部门之一，主要的职能范围包括光学成像设备的维护、培训、实验服务以及部分新型光学成像技术和方法的研发工作。目前，光学影像平台配备的主要成像设备有：激光扫描共聚焦正置显微镜、激光扫描共聚焦倒置显微镜、高通量玻片扫描仪、光片照明显微镜、双光子显微镜、高通量细胞筛选系统以及激光双转盘共聚焦高内涵成像分析系统等多套先进设备，可满足透明化全脑图谱的构建、活体成像、活细胞成像、高通量生物学筛选等实验需求。同时，光学影像中心工作人员可以协助设计合理有效的成像方案，为中心各实验室的研究提供高质量的数据和技术支持。